Fullmetal Alchemist: Brotherhood दो भाइयों, Edward और Alphonse Elric, की कहानी है। वे Amestris नाम के देश में रहते हैं, जहाँ कीमियागरी एक विज्ञान है और उसका एक पक्का नियम है: कुछ पाने के लिए उतनी ही कीमत की कोई चीज़ खोनी पड़ती है। बचपन में दोनों ने अपनी माँ को फिर से ज़िंदा करने की कोशिश करके सबसे बड़ा निषेध तोड़ा और इसकी भारी कीमत चुकाई। Edward ने एक हाथ और एक पैर खो दिया, और Alphonse ने अपना पूरा शरीर खो दिया, अब उसकी आत्मा एक कवच से बँधी है। दोनों जो खोया उसे वापस पाने के लिए Philosopher's Stone की खोज में निकलते हैं। किरदार भाइयों और उनके दोस्तों, सरकारी सेना के अफ़सरों, Ishval के लोगों और दूर के साम्राज्य Xing से आए यात्रियों में बँटे हैं। इस पेज पर 14 किरदार वैसे ही दिए गए हैं जैसे वे शुरुआत में दिखते हैं, बिना किसी मौत, छिपी पहचान या अंत का खुलासा किए।
Alphonse Elric アルフォンス・エルリック
जापानी आवाज़: Rie Kugimiya
Alphonse Elric, Edward का छोटा भाई है। माँ को वापस लाने की नाकाम कोशिश के बाद उसकी आत्मा एक बड़े कवच से जोड़ दी गई, इसलिए अजनबी अक्सर उसे ही बड़ा भाई समझ लेते हैं। वह नरम दिल, विनम्र और जानवरों पर दया करने वाला है, कीमियागरी में Edward जितना ही माहिर है और सबसे ज़्यादा अपना शरीर वापस पाना चाहता है। जापानी आवाज़: Rie Kugimiya; ब्राज़ीली डब: Rodrigo Andreatto।
Winry Rockbell ウィンリィ・ロックベル
जापानी आवाज़: Megumi Takamoto
Winry Rockbell, Resembool गाँव की रहने वाली और Elric भाइयों की बचपन की दोस्त है। वह automail की प्रतिभाशाली मैकेनिक है, जिसने Edward के धातु के हाथ-पैर बनाए और वही उनकी देखभाल करती है, और जब भी वह उन्हें तोड़ता है तो वह नाराज़ हो जाती है। हँसमुख और परवाह करने वाली Winry भाइयों की हमेशा चिंता करती है और देश की सबसे अच्छी इंजीनियरों में से एक बनने के लिए मेहनत करती है। जापानी आवाज़: Megumi Takamoto; ब्राज़ीली डब: Andressa Andreatto।
Roy Mustang ロイ・マスタング
जापानी आवाज़: Shin-ichiro Miki
Roy Mustang सरकारी सेना में कर्नल है और Flame Alchemist कहलाता है, क्योंकि वह खास दस्ताने पहनकर उँगलियाँ चटकाने भर से आग पैदा कर देता है। उसी ने Edward को State Alchemist बनने के लिए चुना था। वह आलसी और घमंडी होने का दिखावा करता है, पर असल में महत्वाकांक्षी है, अपनी टीम का वफ़ादार है और सेना के सबसे ऊँचे पद पर नज़र रखता है। जापानी आवाज़: Shin-ichiro Miki; ब्राज़ीली डब: Hermes Baroli।
Riza Hawkeye リザ・ホークアイ
जापानी आवाज़: Fumiko Orikasa
Riza Hawkeye फ़र्स्ट लेफ़्टिनेंट है और Roy Mustang की सबसे भरोसेमंद सहायक। वह बेहतरीन निशानेबाज़ है, शांत, अनुशासित और गंभीर, और कर्नल को उसके काम पर टिकाए रखती है, कभी-कभी सख़्त याद दिलाकर। उसके पास Black Hayate नाम का एक छोटा काला कुत्ता है, जिसे वह उतनी ही सख़्ती से सिखाती है जितनी सख़्ती से बाकी सब काम करती है। जापानी आवाज़: Fumiko Orikasa।
Maes Hughes マース・ヒューズ
जापानी आवाज़: Keiji Fujiwara
Maes Hughes सैन्य जाँच विभाग में लेफ़्टिनेंट कर्नल है और Roy Mustang का सबसे करीबी दोस्त। वह हर किसी को, चाहे वे चाहें या न चाहें, अपनी पत्नी और छोटी बेटी की तस्वीरें दिखाने के लिए मशहूर है। मज़ाकिया और गर्वीले पिता वाले अंदाज़ के पीछे वह एक तेज़ जाँचकर्ता है, और जब भी Elric भाई Central City आते हैं तो उनका ध्यान रखता है। जापानी आवाज़: Keiji Fujiwara।
Alex Louis Armstrong アレックス・ルイ・アームストロング
जापानी आवाज़: Kenji Utsumi
Alex Louis Armstrong सरकारी सेना में मेजर है और Strong Arm Alchemist कहलाता है। वह बहुत विशाल और मांसल है और एक ऐसे कुलीन परिवार से आता है जो पीढ़ियों से सेना की सेवा कर रहा है। वह जल्दी रो पड़ता है, अपनी मांसपेशियाँ दिखाने के लिए कमीज़ उतारना पसंद करता है और भाइयों के प्रति बहुत स्नेही है, जिन्हें वह मददगार भी लगता है और थका देने वाला भी। जापानी आवाज़: Kenji Utsumi।
Olivier Mira Armstrong オリヴィエ・ミラ・アームストロング
जापानी आवाज़: Yōko Sōmi
Olivier Mira Armstrong एक मेजर जनरल है जो बर्फ़ीली उत्तरी सीमा पर बने किले Fort Briggs की कमान संभालती है। वह Alex Armstrong की बड़ी बहन है और उसका बिल्कुल उल्टा: ठंडी, सीधी बात करने वाली और हर उस व्यक्ति के साथ सख़्त जिसे वह कमज़ोर समझती है। उसके सैनिक उसके प्रति पूरी तरह वफ़ादार हैं, और वह Central चाहे जो कहे, किले को अपने नियमों से चलाती है। जापानी आवाज़: Yōko Sōmi।
Ling Yao リン・ヤオ
जापानी आवाज़: Mamoru Miyano
Ling Yao पूरब के बड़े साम्राज्य Xing का बारहवाँ राजकुमार है। वह अमरता का रहस्य खोजने Amestris आता है, इस उम्मीद में कि इससे वह अगला सम्राट बन सकेगा। वह बेफ़िक्र दिखता है और हमेशा भूखा रहता है, कई बार खाने की कमी से बेहोश तक हो जाता है, पर वह कुशल तलवारबाज़ है और अपने लोगों का गंभीर नेता भी। जापानी आवाज़: Mamoru Miyano।
Lan Fan ランファン
जापानी आवाज़: Nana Mizuki
Lan Fan, Ling Yao की अंगरक्षक है और ऐसे परिवार से आती है जो पीढ़ियों से उसके कबीले की रक्षा करता आया है। वह तेज़ और चुपचाप लड़ने वाली योद्धा है, जो लड़ाई में मुखौटा पहनती है और फेंकने वाले चाकुओं और ब्लेड से लड़ती है। Ling के प्रति पूरी तरह समर्पित, वह अपने दादा Fu के साथ हर जगह उसके पीछे चलती है और उसकी सुरक्षा को अपनी जान से ऊपर रखती है। जापानी आवाज़: Nana Mizuki।
May Chang メイ・チャン
जापानी आवाज़: Mai Gotō
May Chang, Xing की एक छोटी लड़की है जो अपने छोटे से कबीले की रक्षा के लिए अमरता का रहस्य खोजते हुए अकेले Amestris आती है। वह alkahestry का इस्तेमाल करती है, जो Xing की कीमियागरी का एक रूप है और इलाज के लिए भी काम आता है। वह Xiao-Mei नाम की एक नन्ही पांडा के साथ घूमती है और Edward से मिलने से पहले ही उसके बारे में सपनों भरी, रोमांटिक कल्पना रखती है। जापानी आवाज़: Mai Gotō।
Van Hohenheim ヴァン・ホーエンハイム
जापानी आवाज़: Unshō Ishizuka
Van Hohenheim, Edward और Alphonse का पिता है। जब बच्चे छोटे थे तभी वह परिवार छोड़कर चला गया था, और Edward ने उसे माँ को अकेला छोड़ने के लिए कभी माफ़ नहीं किया। लंबा, दाढ़ी वाला और कम बोलने वाला Hohenheim एक बहुत कुशल कीमियागर है, जो देश के रहस्यों के बारे में जितना बताता है उससे कहीं ज़्यादा जानता लगता है। जापानी आवाज़: Unshō Ishizuka।